تمّ بعث جامعة جندوبة بموجب الأمر عدد 1662-2003 المؤرّخ في 4 أوت 2003 والذي يجسّم سياسة الدولة في تكريس لامركزية المعرفة والتكنولوجيا وتعزيز الدور الحيوي للجامعة بجهة الشمال الغربي والتي تضمّ 04 ولايات وهي (جندوبة، باجة، الكاف وسليانة).
منذ تأسيسها، شهدت جامعة جندوبة نموا كبيرا سواءا في عدد المؤسسات التي تمّ إنشاؤها أو في عدد الطلبة والأساتذة والإطار الإداري
وتشمل الجامعة عددا كبيرا من مجالات التكوين: كاللغات والعلوم الإنسانية، الفنون والحرف، الموسيقى والمسرح، العلوم القانونية، الاقتصاد والتصرّف والإدارة، الفلاحة، البيوتكنولوجيا، الإعلامية والرياضة والتربية البدنية.
كما تضمّ جامعة جندوبة 13 مؤسسة جامعيّة تتوزّع كالتالي: (كليّة واحدة، 02 مدارس عليا و10 معاهد عليا) 05 منها ذات إشراف مزدوج: 03 بالاشتراك مع وزارة الفلاحة، واحدة بالإشتراك مع وزارة الصحّة العموميّة وواحدة بالإشتراك مع وزارة الشباب والرياضة.
