تمّ بعث جامعة جندوبة بموجب الأمر عدد 1662-2003 المؤرخ في 4 أوت 2003 لتجسيد سياسة الدولة وتحقيق اللامركزية في المعرفة والتكنولوجيا وتعزيز دور الجامعات في المناطق.
